Jednakże cały czas trwają prace rozwojowe nad jego seryjnym zastosowaniem. Przełom w technice przechowywania wodoru może przyczynić się do masowej produkcji samochodów o napędzie wodorem .
Największą przeszkodą na dzień dzisiejszy jest sposób magazynowania wodoru.Wodór w normalnych warunkach jest gazem, więc jego objętościowa gęstość energii jest bardzo słaba w porównaniu do ciekłych paliw jak benzyna Z tego względu należy go magazynować pod wielkimi ciśnieniami.
Kolejną przeszkodą jest fakt, iż wodór składa się z małych cząsteczek, które przenikają przez większość materiałów, z których wykonuje się zbiorniki .Obecnie prowadzone są badania i prace rozwojowe na zbiornikach wysokociśnieniowych do magazynowania wodoru, w pojazdach, przy ciśnieniach roboczych 700 atmosfer. Zbiorniki te to konstrukcje kompozytowe, które przy zachowaniu podobnych parametrów masowych mają o wiele większe możliwości wytrzymałościowe niż zbiorniki stalowe.

Honda, pomimo przeciwności wyprodukowała pojazd na wodór o zerowej emisji spalin - FCX Clarity Ekologiczna honda dostępna jest na razie tylko w Stanach Zjednoczonych i Japonii. Ze względu na brak odpowiedniej infrastruktury zaopatrzenia w wodór, sprzedaż odbywa się jedynie w Tokio oraz w Kalifornii. Przez pierwsze trzy lata zostanie sprzedanych około 30 pojazdów.
Honda FCX Clarity ma z tyłu 170-litrowy zbiornik ze sprężonym wodorem. Wodór trafia do ogniw paliwowych, w których zostaje pomieszany z tlenem z powietrza. W wyniku reakcji powstaje woda i prąd. Prąd trafia do silnika elektrycznego o moc 136 KM zamontowanego tradycyjnie z przodu auta. Nadmiar mocy zmagazynują specjalne baterie litowo-jonowe. Całość sterowana jest komputerowo.

Z kolei w Europie BMW wprowadził pierwszy pojazd klasy luksusowej z napędem wodorowym- BMW 7 Hydrogen
Niemiecki producent obrał trochę inną drogę wykorzystania wodoru niż Honda. Wodór spalany jest bezpośrednio w cylindrach prawie standardowego silnika spalinowego.
Silnikiem jest 12-cylindrowa jednostka o mocy 260 KM (191 kW), która na napęd wodorowy jest w stanie przyśpieszyć do 100 km/h w 9, 5 s, a prędkość maksymalną ograniczono elektronicznie do 230 km/h. Na pełnym baku wodoru samochód jest w stanie przejechać ponad 700 km, co czyni z niego samochód, który można wykorzystać również w miejscach z niewielką ilością stacji paliw
Z czasem okaże się, czy lepszą drogę wybrała Honda czy BMW.